肺癌领域新突破|泛生子助力华西医院揭示高海拔地区肺癌人群基因突变特征

发布时间:2019-12-25

     近日,国际权威学术期刊《Journal of Thoracic Oncology》(影响因子IF 12.46)发布了由华西医院胸外科与泛生子合作完成的重要研究成果,首次揭示高海拔西藏地区肺癌人群基因突变特征,对指导高海拔地区人群的肺癌精准治疗具有重大意义。


肺癌领域新突破|泛生子助力华西医院揭示高海拔地区肺癌人群基因突变特征


     众所周知,高海拔地区空气含氧量低,而低氧可能是影响肿瘤发生发展的重要因素之一。2018年全球癌症统计数据报告显示,肺癌的发病率和死亡率均列首位,而在高海拔西藏地区,这两项数据分别排在该地区各癌种的第六位和第四位[1]。据此推断,高海拔地区肺癌人群可能具有不同于其他地区肺癌人群的基因特征,且这种特征可能与低氧有关。


     研究团队对 17 例 Ⅰ-Ⅲ 期高海拔地区非小细胞肺癌患者(Tibetan-LUAD/LUSC)的石蜡包埋标本(FFPE)进行全外显子测序,并与相对低海拔地区的高加索非小细胞肺癌人群(TCGA-LUAD/LUSC)(以下简称“高加索人群”)和 汉族非小细胞肺癌人群(Han-NSCLC)(以下简称“汉族人群”)的数据进行比较,以探寻高海拔地区非小细胞肺癌人群的分子特征。


     结果显示,高海拔地区非小细胞肺腺癌人群的TMB(0.84/MB) 略低于相对低海拔地区的高加索和汉族人群,且突变频率最高的依旧是EGFR (L858R和19del),与汉族人群相似而显著高于高加索人群;高海拔地区非小细胞肺鳞癌人群的TMB(4.95/MB)与高加索和汉族人群近似,且突变特征也与高加索和汉族人群相似,均以 TP53突变为主。


肺癌领域新突破|泛生子助力华西医院揭示高海拔地区肺癌人群基因突变特征


     此外,研究还发现碱基C>A 突变频率在高海拔地区非小细胞肺癌患者中显著低于高加索和汉族人群(p<0.001)。既往众多研究表明,c>A 颠换是 signature 4 的典型特征,而该特征与吸烟密切相关[2]。本研究入组人群多为吸烟患者,与高加索和汉族患者研究中吸烟患者比例相似,均表现出了signature 4 的富集。然而,本研究中C>A突变频率却显著低于后两者。这很可能与高海拔地区特有的低氧环境有关。比如低氧降低 G>8-oxodG 的发生率从而降低 C>A/G>T 突变。


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     本研究成果首次揭示了高海拔地区肺癌人群的基因突变特征,为研究低氧环境对肺癌发生发展的影响,提供了珍贵的现实世界模型,并为临床治疗提供了分子层面的精准指导。


     作为癌症精准诊疗先行者,泛生子始终秉承“探索、发现、应用、改变”的科研理念和行动纲领,凭借创新的科研能力,扎根癌症基因组学基础研究领域,在《Nature Genetics》《Cancer Cell》《Nature Communications》《PNAS》等国际权威学术期刊发表论文近20篇,研究内容覆盖遗传易感性、早期筛查、分子病理诊断、用药指导、预后监测等癌症诊疗全周期,研究领域涉及肺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、甲状腺癌、乳腺癌、脑肿瘤以及泌尿系统癌症等众多高发癌种,并逐步攻破液体活检等创新技术领域的瓶颈和难关,实现了一个又一个里程碑式的创举(点击此链接,详细了解泛生子如何破解基因组学奥秘?),并加速推动基础研究成果的临床转化及商业化进程,兼顾技术、产品的可靠性和可及性,力争为更多用户提供先进、可靠、实用的服务,让精准医疗落地施行,让精准医疗普惠大众。


参考文献


[1] 段文鑫,泽永革,丁杰雯,赵玉兰,边巴扎西: 西藏地区1929例恶性肿瘤住院患者构成特征分析. 中国肿瘤 2018, 27(02):114-117.


[2] Alexandrov LB, Nik-Zainal S, Wedge DC, et al. Signatures of mutational processes in human cancer. Nature 2013 Aug 22;500(7463):415-21.doi:10.1038/nature12477.


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